בבעיית הפתולוגיה של המעי הדק, מעניינים במיוחד מצבי חוסר חיסוני המלווים בהתפתחות של אחד מסוגי התהליכים הלימפופרוליפרטיביים - היפרפלזיה לימפואידית שפירה.
במקרים של דיספלזיה בולטת של רקמת הלימפה ולימפומות ממאירות של התמיינות פלסמציטית, נצפות לעיתים קרובות גמופתיות חד שבטיות. במקרה זה, אופי הגמופתיות, ככלל, תואם את הפרשת תאי הפלזמה של השדה שבו מתפתחת הלימפומה.
כיבים לא ספציפיים במעי הדק הם נדירים ביותר. בספרות ניתן למצוא רק תיאורים בודדים של מחלה זו. אלו כיבים לא ספציפיים, בניגוד לכיבים בעלי אופי מבוסס, שיכולים להיות שחפתיים, עגבתיים וסרטניים.
מקום מיוחד בקרב דלקות מעיים כרוניות של אטיולוגיות שונות תופסת דלקת מעיים קרינתית הנגרמת על ידי קרינה מייננת. זה יכול להיות אחד הביטויים של מחלת קרינה או להתרחש כתוצאה מטיפול רנטגן בגידולים ממאירים של חלל הבטן ואיברי האגן.
הפרעות פינוי מוטוריות (דיסקינזיה) של התריסריון מתגלות במקרים של נזק למערכת העצבים המרכזית והאוטונומית, הפרעות אנדוקריניות, מחלות מערכתיות וטפיליות, ובחולים שעברו ניתוח קיבה.
מגה-קולון מולד הוא התרחבות משמעותית של חלק או כל המעי הגס, בדרך כלל עם עיבוי של קרום השרירים של דופן שלו. מגה-קולון מולד יכול להיגרם על ידי מכשולים מסוימים לתנועה נוספת של תוכן המעי הגס (היצרות, מחיצות קרומיות וכו'), אך לרוב מדובר בפגם מולד בעצבוב שלו - אגגליוזיס מולד.
