קדחת דימומית קרים נבדלת ממחלות דימומיות אחרות, שפעת, לפטוספירוזיס, מנינגוקוקמיה, קדחת טיפוס, מחלות כירורגיות עם תסמונת "בטן חריפה"; כמו גם מפורפורה טרומבוציטופנית (מחלת ורלהוף) עם התחלה תת-חריפה אופיינית, היעדר תגובת חום, פריחה דימומית מפטכיות קטנות ועד אכימוזות גדולות על משטחי הכופף של הגפיים, גוף הגוף, דימומים תכופים מהאף ודימומים אחרים, אנמיה היפוכרומית, לויקוציטוזיס, טרומבוציטופניה והיעדר שינויים במערכת הלב וכלי הדם.
