בשחפת ראשונית, הנגע בדרך כלל ממוקם בבלוטות הלימפה, בריאות, בצדר הרחם, ולפעמים באיברים אחרים: כליות, מפרקים, עצמות, הצפק. אזור הדלקת הספציפית יכול להיות קטן מאוד ולהישאר מוסתר במהלך הבדיקה. אם הנגע גדול, הוא מתגלה בדרך כלל במהלך בדיקה קלינית ורדיולוגית של המטופל.
