התפשטות נגיף ה-HIV הביאה לשינויים רדיקליים באפידמיולוגיה של שחפת בעולם. נגיף HIV הוא גורם הסיכון החמור ביותר להתפתחות שחפת בקרב אנשים שנדבקו ב-MBT במאה האחרונה. על פי ארגון הבריאות העולמי, עד שנת 2002 מספר האזרחים עם נגיף HIV עמד על יותר מ-40 מיליון, ויש להניח ששליש מהם יפתחו שחפת.
שחפת מולדת היא נדירה. זיהום של העובר בשלבים המוקדמים של ההריון מוביל להפלות ספונטניות וללידות מתות. אם ההריון נמשך, ילדים נולדים בטרם עת, עם סימנים של היפוטרופיה תוך רחמית, משקל גוף נמוך. בימים הראשונים לאחר הלידה, הילד עשוי להיראות בריא.
נגעים שחפתיים של השלד אצל ילדים ובני נוער מאופיינים בהרס נרחב של עצמות ומפרקים, מה שמוביל לנכות מוקדמת ומתקדמת בהתמדה בהיעדר טיפול הולם. אצל רוב הילדים מתחת לגיל 7, נתונים אנמנסטיים מצביעים על הופעת הסימנים הראשונים של המחלה בשלוש השנים הראשונות לחייהם, אך האבחנה נקבעה בגיל זה רק במחצית מהמקרים.
שחפת של קרומי המוח משפיעה בעיקר על ילדים מתחת לגיל 5. לרוב, המחלה מתפתחת במהלך השנים הראשונות לאחר ההדבקה ב-MBT. כ-70% מהילדים חולים לפני גיל שנתיים. ברוב המכריע של המקרים (90-95%), דלקת קרום המוח השחפתית מתרחשת אצל חולה עם שחפת ריאתית או חוץ-ריאתית פעילה.
נגעים בבלוטות הלימפה ההיקפיות נגרמים לרוב על ידי מיקובקטריה של בקר. יש לקחת זאת בחשבון בעת אבחון באזורים מסוימים ברוסיה, במיוחד באזורים כפריים. מחברים רבים מקשרים את התפתחותו של תהליך ספציפי בבלוטות הלימפה עם הלימפוטרופיזם של MBT ותפקוד המחסום של בלוטות הלימפה, העשירות באלמנטים של מערכת הפגוציטים המונונוגרעינית, שבה מתרחשים לרוב שינויים ריאקטיביים ראשוניים (ולאחר מכן ספציפיים).
כיום, עקב העמידות המוגברת של גוף האדם לשחפת, השימוש הנרחב בחיסונים ספציפיים וחיסון חוזר של BCG, ואבחון בזמן של זיהום ראשוני בשחפת בילדות ובגיל ההתבגרות, שחפת מופצת המטוגנית היא נדירה.
את המקום הראשון מבין הצורות הקליניות של התקופה הראשונית של שחפת בילדים ובני נוער תופסת כיום שחפת של בלוטות הלימפה התוך-בית החזה - פגיעה ספציפית בבלוטות הלימפה של שורש הריאה והמדיאסטינום. התפקיד המוביל בפתוגנזה של שחפת ראשונית ניתן למוקד הריאתי, ברונכואדניטיס נחשבת למרכיב השני שהתפתח לאחר היווצרות המוקד הריאתי.