חיידקים פתוגניים משמשים לעתים קרובות כגורמים סיבתיים לזיהומים ותגובות דלקתיות, שבהן תאים בריאים ניזוקים, הן על ידי החיידקים עצמם והן על ידי תוצרים רעילים של פעילותם החיונית.
כולם פתוגנים של מיקופלזמוזיס אורגניטלי, הפתוגניות שלהם לבני אדם לאור המחקר המודרני אינה מותירה ספק, אם כי זיהום אינו בהכרח מוביל להתפתחות המחלה - מיקרואורגניזמים אלה נמצאים לעתים קרובות אצל אנשים בריאים כמעט.
על פי הסיווג המקובל במיקרוביולוגיה, פוסובקטריה שייכת לפרוקריוטים והם חיידקים אנאירוביים גרם-שליליים החיים בגופם של בני אדם ויונקים אחרים, והם חלק מהמיקרוביוכנוזיס או המיקרופלורה הרגילה הקבועה.
אוראפלזמה היא תושבת המיקרופלורה של מערכת השתן, אך רחוקה מלהיות קבועה. למעשה, זהו מיקרואורגניזם פתוגני מותנה שניתן למצוא באיברי מערכת השתן ולא לגרום לתסמינים כלשהם.
כלמידיה פסיטאצ'י (Chlamydia psittaci) גורמת למחלות אנתרופוזאונוטיות המתפתחות כתוצאה מהדבקה אנושית באמצעות מגע מקצועי, ופחות נפוץ, ביתי עם בעלי חיים וציפורים.
