בפרקטיקה גינקולוגית, מחקר הפרשות מתעלת צוואר הרחם מתבצע על מנת לזהות תאי גידול ממאירים, לזהות פרוטוזואה (טריכומונס) ופלורה (גונוקוקים וכו'), ובפרקטיקה המיילדותית - על מנת לאבחן קרע מוקדם של שלפוחית השתן העוברית.
מחקר (ניתוח) של הפרשות מהנרתיק מתבצע כדי להעריך את אופי המיקרופלורה ולזהות את התהליך הדלקתי, וכן כדי לזהות תאים לא טיפוסיים ולהעריך את ייצור הורמוני המין ("מראה הורמונלית").
גילוי והבחנה של פרוטוזואה (הבחנה בין צורות פתוגניות ללא פתוגניות) היא משימה מורכבת למדי. רוב האורגניזמים החד-תאיים בצואה נמצאים בשתי צורות: וגטטיבי (שלב טרופוזואיטי) - פעיל, נייד, חיוני, רגיש בקלות להשפעות מזיקות (בפרט, קירור) ולכן גוסס במהירות לאחר הפרשה מהמעי, ובצורה של ציסטות (אואויסטות) עמידות להשפעות חיצוניות.
בדרך כלל, עם הכנה נכונה של המטופל, דם סמוי בצואה אינו מתגלה. דימום במערכת העיכול הוא בעיה שרופאים נתקלים בה לעתים קרובות. מידת הדימום משתנה באופן משמעותי, והקושי הגדול ביותר הוא באבחון דימום כרוני קל.
בדיקה מעבדתית של המרה המתקבלת מסייעת להבהיר את אופי התהליך הפתולוגי. בבדיקה חלקית רב-שלבית, נאספת המרה במבחנות נפרדות כל 5 או 10 דקות, זמן הזרימה של כל מנת מרה וכמותה נרשמים.
למחקר (ניתוח) של נוזל השדרה יש ערך אבחוני חשוב במחלות של מערכת העצבים המרכזית וקרומי המוח, כגון דלקת המוח (אנצפליטיס), דלקת קרומי המוח (דלקת של קרומי המוח), ארכנואידיטיס (דלקת של קרום העכביש), עגבת של המוח, תאונות כלי דם, גידולים ופציעות.
