בדיקות פונקציונליות משמשות להבהרת המצב התפקודי של חלקים שונים במערכת הרבייה. עקרון המחקר מבוסס על העובדה שהורמונים המוכנסים לגוף הם בעלי תכונות זהות לאלו האנדוגניים.
מחקר רירית הרחם מבוסס על הופעת שינויים אופייניים בקרום הרירי תחת השפעת הורמוני סטרואידים בשחלות. אסטרוגנים גורמים להתרבות, ופרוגסטרון - לטרנספורמציות הפרשה.
בדיקה גינקולוגית מיוחדת מתחילה בבדיקת איברי המין החיצוניים. במקביל, מוקדשת תשומת לב לשערות באזור הערווה ובשפתיים הגדולות, שינויים פתולוגיים אפשריים (נפיחות, גידולים, ניוון, פיגמנטציה וכו'), גובה וצורת הנקבים (גבוה, נמוך, בצורת שוקת).
טמפרטורת הבסיס או רקטלית (ברקטום) נמדדת על ידי אישה עצמה מדי יום מבלי לקום מהמיטה במשך 10 דקות לאורך המחזור החודשי. טמפרטורת הבסיס אצל אישה בריאה משתנה בהתאם לשלב המחזור החודשי.
ביופסיה של צוואר הרחם. ביופסיה של צוואר הרחם מבוצעת כאשר יש חשד לסרטן או למחלות אחרות. רקמת צוואר הרחם נכרתת לאחר בדיקה קולפוסקופית, שכן הדבר מאפשר קביעה מדויקת של שטח צוואר הרחם לצורך ביופסיה.
הפרטובציה קימוגרפית היא שיטה לחקר פטנטיות החצוצרות על ידי החדרת אוויר או פחמן דו-חמצני לחלל הרחם, לחצוצרות ולחלל הבטן תוך רישום חזותי וגרפי בו זמנית של פעילות ההתכווצות של החצוצרות. הרישום מתבצע באמצעות מכשיר הקלטה מיוחד.
קולפוסקופיה הוצעה בשנת 1925 על ידי הינצלמן. קולפוסקופיה מאפשרת בדיקה מפורטת של החלק הנרתיקי של צוואר הרחם ודפנות הנרתיק באמצעות מכשיר אופטי מיוחד - קולפוסקופ. עיצוב הקולפוסקופ כולל מערכת עדשות אופטיות עם אורך מוקד של 25-28 ס"מ ועיניות מתחלפות המספקות הגדלה פי 6 עד פי 28.
שיטת תגובת שרשרת הפולימראז (PCR) מאפשרת כיום לזהות גורמים זיהומיים שונים הממוקמים במוקד הדלקת. השיטה המולקולרית המודרנית ביותר של הכלאת DNA מאפשרת לזהות את נגיף הפפילומה האנושי לפי סרוטיפים.
שיטות ציטולוגיות לבדיקת חולים. הן מבוצעות למטרת גילוי מוקדם של סרטן הרחם וצוואר הרחם. אופי התהליך הפתולוגי מזוהה על סמך המאפיינים הבאים: מאפיינים מורפולוגיים של תאים, קשר כמותי בין קבוצות תאים בודדות, מיקום אלמנטים תאיים בתכשיר.