קביעת כרומטין X ו-Y נקראת לעתים קרובות שיטה לאבחון אקספרס של מין. נבדקים תאי רירית הפה, אפיתל הנרתיק או זקיק השיער. בגרעיני תאי הנקבה, שני כרומוזומי X נמצאים בקבוצה דיפלואידית, שאחד מהם אינו פעיל לחלוטין (ספירלי, דחוס היטב) כבר בשלבים המוקדמים של התפתחות העובר ונראה כגוש של הטרוכרומטין המחובר לקרום הגרעין.