חיידקים פתוגניים משמשים לעיתים קרובות כסוכנים סיבתיים של דלקות ותגובות דלקתיות, שבהן תאים בריאים ניזוקים, הן על ידי החיידקים עצמם והן על ידי מוצרים רעילים של פעילותם החיונית.
כולם סוכני סיבתי של mycoplasmosis ואברי המין, פתוגניות שלהם עבור בני האדם לאור המחקר הנוכחי לא מותיר ספק, כי הזיהום אינו בהכרח להוביל להתפתחות המחלה - אורגניזמים אלה נמצאים בדרך כלל אצל אנשים בריאים.
לדברים שאומצו fuzobakterii מיקרוביולוגיה התיוג כולל פרוקריוטים, והם חיידקי גרם שלילי, אנאירוביים השוכנים בבני אדם ויונקים אחרים, כחלק microbiocenosis או microflora הנורמלי DC.
Ureaplasma הוא תושב microflora של דרכי השתן, אבל זה רחוק מלהיות קבוע. למעשה, זהו מיקרואורגניזם פתוגני מותנה כי ניתן למצוא את האיברים של מערכת השתן ואינו גורם לתסמינים כלשהם.
