השיטה החדשה תאפשר פיתוח תרופות מהר יותר

קבוצה בינלאומית של מדענים מצרפת, אמריקה ורוסיה פיתחו שיטה ייחודית ליצירת תרופות, השונה מהמהירות הקיימת עד כה. הודות לדפוס חדש של יחסי גומלין בין חלבונים, ניתן להאיץ את תהליך פיתוח החיסונים והתרופות, ופוטנציאל חדש למחקר ייפתח בפני ביוכימאים.

עכשיו המדענים מתמודדים עם המשימה של פיתוח תרופות כגון זה לא יגרום לתגובות שליליות, ייקלטו במלואם על ידי הגוף ולהשמיד תאים לא בריאים במיוחד. עבור תא החלבון, חומר הבניין העיקרי, בתא אחד יש אינטראקציות רבות (מאות אלפים), וללמוד תהליכים אלה יאפשר למדענים לפתח דרכים חדשות לטיפול במחלות מסוכנות, ליצור חומרים ביולוגיים חדשים להמצאת תרופות.

מומחים ממדינות שונות תחת הדרכתו של פרופסורים מאוניברסיטת סטוני ברוק דמיטרי קזקוב מסוגל ליצור ולחקור מודל ממוחשב מסוגל כמה פעמים מהר לחשב את המבנה שנוצר על ידי האינטראקציה של שני חלבונים (הדגם החדש הוא פי עשרה מהר יותר מאשר מערכות דומות הזמינים כיום) .

לדברי מדענים, מחקר מעבדה הוא די יקר, שכן ריאגנטים וציוד יקר נדרשים לביצוע שלהם. עבור קבוצות מחקר קטנות, האפשרות הטובה ביותר היא הדמיית מחשב. עכשיו יש הרבה מערכות מחשב לחשב את האינטראקציה בין חלבונים, אבל, למרבה הצער, כל המערכות הקיימות אינם מסוגלים לחשב מספר רב של אינטראקציות חלבון בתוך זמן קצר. כל האלגוריתמים כיום בשימוש, לפקח תצורות בנפרד ללא שילובם, ואת גישת צוות החדשה פרופסור קזקוב מאפשרת לנו לנתח את כל המערכות בו זמנית תוך זמן קצר, וזה מאפשר לך לזרז את התהליך עד 100 פעמים מבלי לפגוע באיכות של התוצאה הסופית.

אם ניקח בחשבון את מודל המחשב, מומחים יוכלו לא רק לפתח תרופות מהר יותר, אלא גם להפחית באופן משמעותי את עלותם. השיטה החדשה של דוגמנות מחשב מאפשרת לא רק לחשב אינטראקציות חלבון, אלא גם לנתח את המבנה של אורגניזמים חיים (הן בעלי חיים והן אנושיים). לדברי מומחים, השיטה החדשה תאפשר לפתח תרופות יעילות עבור HIV וסרטן, תוך זמן קצר ניתן יהיה להכין מספר מספיק של תרופות.

המאמר עם תוצאות העבודה של המדענים שפורסם באחד העתים המדעיים, שבו מומחים תיאר בפירוט דרך חדשה של מודלים ממוחשבים של אינטראקציות חלבון.

עבודה זו אינה מיועדת לשימוש מסחרי, אך היא מחקר בסיסי, כך שניתן לדבר על העבודה שנעשתה מרגע שהיא מופיעה בפרסום המדעי. עכשיו האלגוריתם החדש כבר בשימוש על שרת ציבורי ClusPro כמו מערכת מחשוב חדשה זמינה לכל הנוסעים.

[1], [2], [3], [4]